La participation des étudiants de DELGEME de l’Université de Jomo Kenyatta aux cours en ligne organisés par H3ABionet pour 3 mois

Contexte

Les cours en ligne organisés par H3ABionet pour 3 mois, du 11 septembre 2018 au 13 décembre 2018, ont regroupé des étudiants boursiers de DELGEME en Master à l’université Jomo Kenyatta du Kenya à Bamako – Mali.

Ces cours s’adressaient aux personnes issues des études en biologie moléculaire ayant une connaissance de base en biochimie et/ou en génétique, et qui souhaitaient apprendre l’utilisation de la bio-informatique.

Dans ce cadre, 8 étudiants, dont 7 boursiers de DELGEME de JKUAT et 1 étudiant de l’USTTB, ont participé à ce cours avec l’assistance de Dr. Antoine Dara, Post-Doc ; Mlle Aoua Coulibaly, PhD ; Dr. Moussa Djimdé, étudiant de DELGEME en Master ; et M. Issouf Fané, informaticien de DELGEME. Cette contribution visait à apporter un appui lors des travaux pratiques du cours et à assurer la liaison avec l’équipe centrale de l’IBT pour coordonner l’administration des salles de classe au niveau local.

Les cours se tenaient deux fois par semaine, tous les mardis et jeudis, de 8 h 30 à 12 h 30.

Objectifs

Les cours visaient à fournir une introduction au domaine de la bio-informatique, en mettant l’accent sur d’importants outils et ressources en la matière.

Ils visaient également à combiner des sessions théoriques et pratiques afin de permettre aux participants d’acquérir une expérience pratique dans l’utilisation des divers outils et ressources.

Méthodologie

Un modèle d’apprentissage à distance a été utilisé pour ce cours.

Les formateurs ont préenregistré leurs exposés, qui ont été ensuite téléchargés et visionnés par les classes locales lors des séances de contact. Ces séances ont été suivies de sessions pratiques où les participants ont réalisé des travaux pratiques.

Les salles de cours ont été installées sur différents sites en Afrique (en fonction de la disponibilité des ressources) et ont relié le formateur aux participants via le système de téléconférence Adobe Connect.

Programme de cours

Le programme du cours a couvert les principaux thèmes suivants :

• Ressources et bases de données bio-informatiques
• Linux
• Théorie et applications de l’alignement des séquences
• Alignement multiple de séquences (MSA)
• Génomique, évolution moléculaire et phylogénétique

Résultats et attendus

À la fin du cours, les participants ont été capables :

• D’expliquer l’utilisation de la bio-informatique
• De nommer les techniques et outils bio-informatiques clés
• De repérer les bases de données biologiques importantes et de récupérer des données
• D’utiliser efficacement les outils sélectionnés pour exécuter des analyses bio-informatiques spécifiques et de comprendre les forces et les limites des différentes techniques